Di seguito i risultati ottenuti nell’ambito dell’attività sorveglianza coordinata dall’Istituto Superiore di Sanità (ISS) “Stima della prevalenza delle varianti VOC (Variant Of Concern) e di altre varianti di SARS-CoV-2 in Italia” sui campioni positivi per COVID-19 notificati in Veneto il 3 gennaio 2022.

Campioni analizzati

È stato ottenuto il genoma completo per un totale di 316 campioni inviati da 13 diversi laboratori distribuiti nella Regione del Veneto.

Prevalenza delle varianti

Il 66.1% (209/316) dei campioni analizzati appartiene alla variante Omicron, mentre il rimanente 33.9% (107/316) appartiene alla variante Delta. Rispetto alla precedente sorveglianza del 20 dicembre 2021, la variante Omicron mostra un aumento della prevalenza di 57.9 punti percentuali, passando dallo 8.2% al 66.1% in 14 giorni, e diventando quindi la variante prevalente nella regione.

La frequenza della variante Omicron non è equamente distribuita tra le diverse province ma passa da un 50% per la provincia di Treviso all’83% nella provincia di Belluno. In dettaglio:

  • Belluno: 83% Omicron
  • Rovigo: 81% Omicron
  • Venezia: 68% Omicron
  • Padova: 66% Omicron
  • Vicenza: 65% Omicron
  • Verona: 61% Omicron
  • Treviso: 50% Omicron

Lineage delle varianti

All’interno della variante Omicron si distinguono tre diversi lineage: BA.1, BA.2 e BA.3. Tutti i campioni della variante Omicron identificati in Veneto appartengono al lineage BA.1, il lineage prevalente nella maggior parte dei Paesi europei.

I campioni appartenenti alla variante Delta si distribuiscono all’interno di 19 diversi lineage:

  • B.1.617.2 (N=1)
  • AY.102 (N=1)
  • AY.106 (N=1)
  • AY.120 (N=1)
  • AY.121 (N=1)
  • AY.122 (N=10)
  • AY.124 (N=1)
  • AY.126 (N=6)
  • AY.127 (N=2)
  • AY.34 (N=1)
  • AY.4 (N=23)
  • AY.4.2 (N=3)
  • AY.4.2.3 (N=7)
  • AY.43 (N=19)
  • AY.46 (N=1)
  • AY.46.6 (N=6)
  • AY.9.2 (N=1)
  • AY.98 (N=2)
  • AY.98.1 (N=20)

I lineage AY.4, AY.98.1 e AY.43 sono quelli riscontarti con una maggiore frequenza tra i campioni Delta (17.7%-21.5%).

Ringraziamenti

Si ringraziano l’UOSD Genetica e Citogenetica – Azienda ULSS 3 Serenissima per aver contribuito alla generazione delle sequenze e le ULSS 1, ULSS 2,  ULSS 5, ULSS 6, ULSS 7, ULSS 8, ULSS 9, le U.O.C Microbiologia e virologia dell’Azienda ospedaliera-Università di Padova e dell’Azienda ospedaliera universitaria integrata di Verona che hanno selezionato e inviato i campioni oggetto della sorveglianza.